Ubicación: Sierra, ceja de selva y selva amazónica; al norte del Perú.
Superficie: 39 249,13 km2.
Topografía: Su relieve es muy accidentado y abarca las regiones interandina y selvática. En él destacan la Cordillera del Cóndor (Frontera Perú-Ecuador), la Cordillera Central Andina, que da origen a la Cuenca Hidrográfica del río Marañón, que comprende la región de los pongos.
Pisos altitudinales: Quechua, Suni y Rupa Rupa.
Clima: Frío y seco en altitudes medias superiores a 3 000 mts. en el Sur del departamento. Frío y nuboso en la parte Sur-oriental donde existen punas como la de "Pishco Huánuna" en los límites con la región de San Martín. Templado Cálido con alta humedad Atmosférica y constante nubosidad en las partes altas de la Cordillera El Cóndor, y en relieves andinos del Sur y Sur-Este.
Altitud:
- 2 334 msnm (Ciudad de Chachapoyas) – (Mínima)
- 230 msnm (Santa María de Nieva.) - (Máxima)
- 3 450 msnm (Chuquibamba.)
Límites:
Por el Norte: República del Ecuador.
Por el Este: Regiones de Loreto y San Martín
Por el Sur: Regiones San Martín y La Libertad
Por el oeste: República del Ecuador y la región de Cajamarca.